Olá,
Para registro: sobre o "meu" caso, o problema não era com a SEFAZ, mas com o processo da empresa.
Eles estavam fazendo uma devolução de compras, onde informavam corretamente a NF referenciada. O XML era formado com a chave da NF da compra, tudo isso estava correto.
Porém, na entrada da NF de compras, não estavam informando a série da NF - sempre ficava com série = 0. Aí, obviamente, a chave de acesso da NF registrada estava errada (quando série <> 0), e quando tentava autorizar a NF de devolução, que informava esta chave errada, a SEFAZ rejeitava a NF (corretamente).
Após ajustar o procedimento na entrada, tudo passou a funcionar direito.
Abs,
Eduardo